以色列 Enzootic 公司和 NRGene 公司合作组装首个高质量的雌虾基因组以提高全雌虾繁殖效率
 
特拉维夫,香港和圣路易斯 – 2018 年 9 月 5 日 – Enzootic,一家引领全雌虾养殖革命的动物生物技术及遗传学公司,与     NRGene,全球领先的基因组大数据分析服务供应商,合作组装了世界上第一个高质量的罗氏沼虾基因组。
 
雌虾和雄虾基因组的最大分别在于,雌虾有 W 染色体而雄虾没有。尽管 W 染色体具有显而易见的重要影响,该染色体独特的序列和编码基因此前一直无法被破解。
 
研究雌虾基因组的动机来自于养殖全雌性虾所具有的显著生长优势。处于单性技术商业化应用领先地位的 Enzootic 此次与  NRGene 合作,旨在更深入探究雌虾的生长优势,提高全雌种虾的繁殖性能。
 
“对这一杰出的高质量基因组的初步研究,已让我们发现了诸多先前未知的专属于 W 染色体的特异基因。这些基因奇妙的排列和功能基序,或可揭示 W 染色体的重要性及其对雌虾生长性能的潜在影响。”以色列内盖夫本 - 古里安大学甲壳类动物内分泌学家 Amir Sagi 教授,同时是 Enzootic 的联合创始人,他解释道,“未来还需要进一步研究去发掘这些新基因的作用以及它们如何在单性养殖条件下调节雌性的生理机能。”
 
“与 Enzootic 合作组装首个高质量、达到参考基因组水平的虾基因组,是 NRGene 公司支持和加强如对虾和其他水产养殖品种等重要动物蛋白品种育种战略的一部分,这些水产品种是重要食物来源。”NRGene 首席执行官 Gil Ronen 博士说道, “我们不断努力持续提升我们的技术,使之不断进步,以期能对世界食品供给带来强有力的、积极的影响。”
 
实际上,在不到两年的时间内, NRGene 的 DeNovoMAGIC 3.0 软件已组装了 350 多个基因组,包括小麦、马铃薯、草莓、黑麦、燕麦、黑麦草和现在的首个雌虾基因组。
 
由 DeNovoMAGIC 组装的这一超复杂雌虾基因组,组装大小达到 3.57 Gbp,N50 支架高达 19.84 Mbp,BUSCO 基因评估为 92.7%。
 
上海海洋大学水产与生命学院副院长黄旭雄教授高度肯定了该雌虾基因组组装对虾类生产的影响:“养殖虾类是许多国家重要的蛋白质来源,尤其是中国,仅 2016 年,中国就生产了约 330 万公吨的海水虾和淡水虾,约占全球养殖虾产量的 50%。这个新组装的高质量罗氏沼虾基因组将被作为先进育种技术的重要工具,用于今后几年的虾类育种中,推动虾类养殖产业更高效且更具可持续性地发展。”他补充说道,“如今淡水虾产业仍主要依赖传统的、相对低技术含量的方法,落后于其他先进的畜牧业。我相信借助基因组工具和引入单性养殖技术,该产业将真正迈入 21 世纪。”